DOI具有唯一性，同一個數位物件僅能擁有一個DOI，因此將以出版品的最終出版版本為註冊DOI的依據，藉以維護DOI的唯一性，亦避免使用者混淆出版品版本。除此之外，當物件有延續性出版的可能，如將研究論文改寫為期刊論文，則應分視為兩個不同的作品，各自申請DOI，供後進研究者掌握最新研究版本。

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